หน่วยงานดำเนินการขอเบิกเงินรายได้จากโครงการบริการดังกล่าวกับมหาวิทยาลัยเป็นรอบ เช่น เบิกเป็นรายเดือน รายไตรมาส หรือตามความเหมาะสม โดยให้มหาวิทยาลัยหักค่าบริหารจัดการโครงการไว้ตามที่ตกลง ซึ่งปกติ หากเป็นการผลิตสินค้าโดยใช้สถานที่และเครื่องมือของมหาวิทยาลัย มหาวิทยาลัยมีระเบียบให้นำส่งค่าบริหารจัดการโครงการในอัตราร้อยละ 20 (ประกาศมหาวิทยาลัย : คลิก) รายได้นอกเหนือจากค่าบริหารจัดการ หน่วยงานสามารถเบิกไปใช้เป็นค่าใช้จ่ายในการดำเนินงานได้โดยไม่ต้องรายงานมหาวิทยาลัย

“สำหรับหน่วยงานที่ประสงค์จะดำเนินงานในรูปแบบวิสาหกิจ โปรดศึกษารายละเอียดเกี่ยวกับการจัดตั้งวิสาหกิจก่อน” 
( ประกาศเกี่ยวกับการจัดตั้งวิสาหกิจ : คลิก)